在生物學中, 次氯酸被嗜中性白血細胞用來殺減細菌. 在化學反應中, 將氯溶於水中時, 產生有殺菌作用的刺氯酸和次氯酸根的存在比例, 隨著酸鹼質的變化而不同, 其殺菌力也有很大的差異. 次氯酸在 PH5.0~6.5微酸性環境下, 可以高比例的濃度存在. 而次氯酸的殺菌力為次氯酸根的80~150倍, 並且具可以達到殺菌還可以抑制病毒且對環友善, 人體無害.
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